La relation qui lie fonctionnement et biodiversité des écosystèmes fait toujours l'objet d'un vif débat en écologie (cf Hector, 2011 dans Nature, ou Adler et al., 2011, dans Science).  Elle est de fait une clef incontournable dans la construction de modèles prédictifs par la caractérisation des interactions. Les unités Eco&Sols et MISTEA ont récemment élaboré un modèle conceptuel probabiliste qui suppose qu'un écosystème est constitué d'assemblages aléatoires de communautés, elles-mêmes composées d'assemblages d'éléments, individus ou espèces. Le fonctionnement proposé de l'écosystème dépendrait à la fois des fonctions écologiques portées par les communautés, et de leur stabilité au sein de l'écosystème. Les premiers résultats montrent que ce modèle est générique des formalismes précédemment proposés et qu'il est en bon accord avec les données rapportées dans la littérature.